CSBC 2011 - XXI Congresso da Sociedade Brasileira de Computação

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e-Science - V e-Science Workshop

Coordenação
- Fábio André Machado Porto, LNCC (coordenador geral)
- Marisa Fabiana Nicolas, LNCC (coordenadora geral)
- Edgard de Faria Correa, DIMAp-UFRN (coordenador local)

Descrição

As últimas décadas têm testemunhado uma revolução na maneira em que a Ciência e as Engenharias vêm sendo conduzidas. Em particular, a Computação apresentou-se como uma terceira abordagem para a pesquisa, em complemento às tradicionais abordagens teórica e experimental.

Na medida em que novos instrumentos permitem avanços significativos em áreas como a Astronomia, Biologia, Física e Ecologia, sistemas computacionais colocam-se no caminho crítico do processo científico. Naturalmente, a necessidade de apoio no uso de tais instrumentos e processos computacionais derivados impulsionam fortemente o desenvolvimento de sistemas computacionais. Em paralelo à pesquisa in-silicon, simulações computacionais apresentam-se como um novo ator no processo científico. Simulações são utilizadas em diversas áreas onde observação de fenômenos se mostram dispendiosas, como no caso de perfuração de poços de petróleo, ou invasivas, como no caso da neurociência. Em ambos os casos, o desenvolvimento da Ciência da Computação no suporte à Ciência se mostra fundamental e indiscutível.

Avanços recentes nas áreas de engenharia de software, bancos de dados, bioinformática e sistemas distribuídos, incluindo ontologias, modelagem de workflows e processos científicos, serviços web semânticos, gerência de componentes de software, computação em nuvem e em grid, proveniência de dados, "curagem" de dados (data curation), algoritmos de alinhamento e de bioinformática, entre outros, representam contribuições da Computação para os desafios da ciência computacional. Estas e outras iniciativas na área de Ciência da Computação têm sido coletivamente identificadas como e-Ciência (do inglês e-Science). A importância do tema pode ser medida no grande número de projetos de pesquisa e inovação nas esferas nacional e internacional.

O V e-Science Workshop tem por objetivo reunir trabalhos nas áreas de bancos de dados, engenharia de software, bioinformática e sistemas distribuídos servindo de base para o desenvolvimento de uma infraestrutura de suporte à Ciência, ao ciclo experimental e simulações computacionais. O tema do Workshop faz parte do direcionamento de pesquisa organizado pela Sociedade Brasileira de Computação (SBC) e reportado no documento Grandes Desafios da Pesquisa em Computação no Brasil 2006 a 2016.

O e-Science Workshop funciona como o principal fórum brasileiro para apresentações e discussões entre membros da comunidade de e-Ciência. O evento estimula a criação de parcerias em pesquisas e no desenvolvimento de produtos e ferramentas tendo como alvo aplicações de e-Ciência. As três edições iniciais do evento foram realizadas junto ao Simpósio Basileiro de Banco de Dados (SBBD) e ao Simpósio Brasileiro de Engenharia de Software (SBES), de maneira que várias parcerias entre grupos das áreas de bancos de dados e engenharia de software nasceram como fruto desses encontros. A partir da quarta edição, este evento vem fazendo parte do CSBC oferecendo maior visibilidade à comunidade de Computação. Nesta quinta edição, a área de bioinformática, que sempre participou de outras edições do evento, aparece representada pela coordenadora geral Marisa Nicolas, o que deve ainda mais fomentar a participação de colaboradores das Ciências Biológicas.

Palestras

Lista de artigos técnicos aceitos para o e-Science Workshop:

Scalable Simulation of 3D Wave Propagation in Semi-Infinite Domains Using the Finite Difference Method on a GPU Based Cluster Thales Luis Sabino, Marcelo Zamith, Diego Brandao, Anselmo Montenegro, Esteban Clua, Mauricio Kischinhevsky

eScience-as-a-Service: Desafios e Oportunidades para a Criação de Nuvens Científicas Rostand Costa, Francisco Brasileiro, Guido Lemos Filho, Dênio Mariz Sousa

High Performance Computing for Protein Sequence Modeling Raquel Melo, Karine Bastard, Francois Artiguenave

Uma Avaliação da Distribuição de Atividades Estática e Dinâmica em Ambientes Paralelos usando o Hydra Fernando Chirigati, Vítor Sousa, Eduardo Ogasawara, Jonas Dias, Daniel de Oliveira, Fabio Porto

Managing Animal Sounds - Some Challenges and Research Directions Daniel Cugler, Claudia Bauzer Medeiros, Luís Felipe Toledo

Predição de Fluidos em um Reservatório Petrolífero Utilizando Métodos de Previsão de Séries Temporais Harold Bustos, Marcelino Pereira, Cláubio Bandeira, Ewerton da Costa Ribeiro

Métricas para ontologias no formato OBO: Um estudo utilizando o Cytoscape Ana Carolina Assaife, Fernanda Bruno dos Santos, Jonice Oliveira, Maria Luiza Machado Campos

Tratamento de Inferência em Banco de Dados Ecológicos Maira Poltosi, Daniele Palazzi, Ana Maria Moura, Fabio André Machado Porto, Frederic Valentin, Jean Louis Valentin

Lista de pôsteres aceitos para o e-Science Workshop:

VTPortal: a Scientific Community Web Portal for Reusable Workflows Sergio Manuel Serra da Cruz, Marta Mattoso

Aplicação de inferência difusa em bioinformática para identificação de SNPs Wagner Arbex, Fabrízzio Oliveira, Luís Carvalho

Composicionalidade e Reuso em Workflows Científicos com Propriedades Não-Funcionais Vivian Medeiros, Antônio Tadeu Azevedo Gomes

Human Transcriptional Regulation Interaction database (HTRIdb): Atualização 2010 Luiz Bovolenta, Marcio Acencio, Ney Lemke

Tópicos de interesse
Os tópicos de interesse do V e-Science Workshop incluem (mas não estão limitados a):
- e-Ciência e aplicações em grid
- e-Ciência e computação em nuvem
- Gerência de workflows científicos
- Bioinformática e e-Saúde
- Ontologias e bancos de dados em e-Ciência
- Bancos de dados de Bioinformática
- Proveniência de dados e processos
- Modelos e técnicas colaborativas de e-Ciência
- Técnicas de gerência de dados científicos
- Organizações virtuais para e-Ciência
- Arquiteturas baseadas em serviços
- Modelos econômicos para computação em nuvem e grid
- Grids computacionais autonômicas, de tempo-real e auto-organizáveis
- Web Semântica para e-Ciência
- Ambientes de experimentação para e-Ciência
- Processo experimental para Ciência em larga escala
- Gerência de conhecimento científico aplicado para contextos de larga escala
- Artes, Ciências Humanas e e-Social
- Ciência Engenharia e Física
- Ciência Meterológica e da Terra

Indicações para submissões
O Workshop aceitará submissões de artigos técnicos e pôsteres escritos em inglês ou português. Artigos técnicos não poderão ultrapassar oito páginas e pôsteres devem limitar-se a quatro páginas. Artigos e pôsteres devem ser formatados em PDF utilizando o estilo dos artigos da SBC. A submissão dos trabalhos será exclusivamente eletrônica, através do sistema JEMS de submissões de artigos da SBC.

Artigos técnicos e pôsteres serão revisados segundo o seguinte critério: adequação ao escopo do Workshop, relevância, qualidade técnica, clareza e originalidade. Artigos técnicos descrevendo trabalhos preliminares e pesquisas em andamento serão também considerados. Validações experimentais comprovando a qualidade das propostas são bem vistas, porém não são exigidas como critério de aceitação de artigos; artigos técnicos, entretanto, devem apresentar os trabalhos relacionados. Artigos técnicos e pôsteres passarão por um processo de revisão de pares (pair-review), designado pela Coordenação do Comitê de Programa. Artigos técnicos selecionados serão apresentados oralmente durante o Workshop e publicados no CD da conferência, enquanto pôsteres selecionados serão apresentados durante a sessão de pôsteres do evento e também publicados no CD da conferência. Pelo menos um autor de cada pôster deve comparecer ao evento para discutir o trabalho com o público, durante a sessão de pôsteres.

Datas importantes:
- Data limite para submissão dos trabalhos: 31 de março de 2011 7 de abril de 2011
- Notificação dos trabalhos aceitos:              2 de maio de 2011
- Data limite para envio das versões finais:  23 de maio de 2011

Comitê Diretivo
- Fabio Porto - LNCC
- Fernanda Campos - UFJF
- Jonice Oliveira - DCC-UFRJ
- Marisa Fabiana Nicolas - LNCC
- Maria Claudia Cavalcanti - IME-RJ
- Vanessa Braganholo - IC-UFF